郭昕

研究副教授

生物医学工程创新中心

E-mail: guox@sustc.edu.cn

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 南方科技大学创新创业学院研究副教授，美国硅谷Apostle 公司及中国南方科技大学-Apostle联合产业项目副总裁。郭昕博士于美国杜克大学取得计算机科学博士；于德国马普所取得信息学硕士；于日本千葉工業大学取得信息学本科。 郭昕博士拥有超过10年的高性能计算、机器学习和人工智能研发经验；有多项涉及复杂生物技术大数据的数据算法及数据库软件的开发经验； 有多篇AI用于生命科学领域的专著，包括 PNAS 第一作者专著。郭昕博士为Apostle生物信息学副总裁。此前，郭昕博士在美国加州硅谷的吉利德科学公司（Gilead Sciences）任研究科学家，研究组组长； 曾担任全球领先的抗丙型肝炎药物索菲布韦片项目的临床基因组学数据项目负责人。

研究方向

 1、机器学习，人工智能技术在疾病诊断与治疗中的应用；

 2、大数据技术的医学应用。

发表期刊和会议论文

Journal Publications

· X Guo, A Bernard, DA Orlando, SB Haase, & AJ Hartemink. (2013). “Branching process deconvolution algorithm reveals a detailed cell-cycle transcription program”, Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS), 110, E968-E977.

· MB Mayhew, X Guo, SB Haase, & AJ Hartemink. (2012). “Close encounters of the collaborative kind”, IEEE Computer, 45, pp. 24-30. (cover feature)

· X Guo, ML Bulyk, & AJ Hartemink. (2012). “Intrinsic disorder within and flanking the DNA-binding domains of human transcription factors”, In Pac Symp Biocomput 2012 (PSB12), pp. 104-115.

· X Guo, & AJ Hartemink. (2009). “Domain-oriented edge-based alignment of protein interaction networks”, Bioinformatics, 25, pp. i240-246.

Clinical Conference Abstracts

· BR Bhandari, S Lee, X Zhao, E Huntzicker, X Guo, et al. “The biological and clinical relevance of anti-metalloproteinase-9 antibody (GS-5745) in treatment of ulcerative colitis patients”, ECCO, Journal of Crohns&Colitis, 10, S473-4, 2016.

· AJ Thompson, O Podlaha, Z Jiang, X Guo, L Zhuo, et al. “Deletion of APOBEC3B is Associated with Hepatitis B eAg Status in Patients with Chronic HBV Infection”, AASLD, Hepatology, 62, 1013-4A, 2015.

· NH Afdhal, TJ Urban, ZD Goodman, K Patel, D Ge, X Guo, et al. “Genome Wide Association Study (GWAS) Identifies a SNP Near the MRC2 (mannose receptor C, type 2) Gene Associated with Increased Liver Collagen content in Caucasian HBV patients”, AASLD, Hepatology, 60, 414A, 2014.